RNA Virus Genome Sequencing SARS-CoV-2

by | Jun 11, 2020

PAKET 1
Re-Sequencing

  • Menggunakan Illumina Platform (at least 1 Gb data).
  • Type of sample = cDNA
    Ekstraksi RNA dari swab nasofaring, jangan lupa berikan DNase untuk menghilangkan human genome (pastikan yang terekstraksi adalah RNA human beserta RNA virus, tanpa ada kontaminasi genomic DNA). Convert ke cDNA.
  • cDNA requirement adalah 1.
  • Tidak ada minimum.

 

PAKET 2
Complete Genome Sequencing

  • Paket ini lebih untuk customer yang melakukan riset untuk mengetahui complete genome, assembly genome atau customer yang mau mendapatkan reference genome dari isolate yang baru (karena virus ini terus menerus evolving).
  • Menggunakan Illumina Platform, digabung dengan Oxford Nanopore Platform (Illumina 1 Gb data + Oxford Nanopore 1 Gb data).
  • Type of sample = cDNA.
  • Ekstraksi RNA dari swab nasofaring, jangan lupa berikan DNase untuk menghilangkan human genome (pastikan yang terekstraksi adalah RNA human beserta RNA virus, tanpa ada kontaminasi genomic DNA). Convert ke cDNA.
  • cDNA requirement adalah 1.
  • Tidak ada minimum.